טֶכנוֹלוֹגִיָה

כיצד מימון המונים ומחקר קוד פתוח ילחמו בסרטן

איזה סרט לראות?

יום בשבוע:

ז'ָאנר:

סוּג: סרט סִדרָה

מקור: Indysci.org

מה הפירוש של גישת מחקר קוד פתוח לסרטן? כיצד מימון המונים יעזור לפתח תרופות טובות יותר מהר? כיצד הנגשת נתוני פרויקט מחקר לכל אחד תפתח דרכים חדשות למחקר וחדשנות? כימאי שכותב תוכנה מאז ילדותו שואף לגלות.

חוקר בשם יצחק יונמוטו מיישם כמה ממושגי יוזמות תוכנת קוד פתוח למחקר סרטן. יונמוטו מתחייב פרויקט מרילין , קמפיין לפיתוח תרופה נגד סרטן ללא פטנטים. הפרויקט מקים לתחייה את המחקר על תרכובת נגד סרטן בשם 9-deoxysibiromycin , or9DS, אשר הוכח כיעיל כנגד כמה סוגים של סרטן בבדיקות מוקדמות. פרויקט מרילין גם מבקש לשנות את הדרך בה חוקרים ומשחררים תרופות. ה הצעת פרוייקט מסביר:

'המטרה החברתית היא להדגים כי ניתן לממן מחקר תרופתי יישומי באמצעות מודל מימון המונים וכי ניתן לשחרר את התוצאות לרשות הציבור, ללא פטנט. בסופו של דבר, מטרת המטרה החברתית היא לעודד יצרנים לייצר תרופות בזול, ולשפר את הגישה לתרופות אלה. '

סיבירומיצין, תרכובת האם של 9DS, נחקר במקור בשנות השבעים על ידי מדענים סיביריים שחשבו שיש לו פוטנציאל לטיפול בסרטן. 'זו תרכובת רעילה המיוצרת על ידי חיידקי אדמה ומתפקדת על ידי עצירת שכפול DNA. לכן, יש לו פוטנציאל ככימותרפיה נגד סרטן, ' מסביר את הצעת פרויקט מרילין. עם זאת, הם גילו שהוא רעיל לבבי, גורם לסטרס בלב, והפסיק את המחקר שלהם. פרויקט 9DS פותח על ידי ברברה גררטאנה באוניברסיטת מרילנד, קולג 'פארק, כאשר פיתחה שיטה לייצור אנלוגים של סיבירומיצין ללא אטום חמצן שנחשבה כגורמת לקרדיוטוקסיות. הסרת מולקולת החמצן ביטלה את תופעות הלוואי, ובאמת הפכה את התרופה ליעילה יותר.

גררטאנה נכנס אז לעבודה במכון הלאומי לבריאות, ולא הצליח להמשיך במחקר. סביר להניח שחברות תרופות לא יתנו חסות למחקר מכיוון שכבר פרסמה את תוצאותיה ללא פטנט. אך מכיוון שהעבודה לא עברה פטנט, כעת היא נחלת הכלל. לשם נכנס יונמוטו. 'למה להכין סמים בלי פטנטים?' האתר Indysci.org שואל.

'כשסאלק וסבין ריפאו פוליו, הם לא רשמו פטנט על החיסון. הגיע הזמן לפתח תרופה נגד סרטן ללא פטנט למאה ה -21. כמו תעשיית התרופות כיום, תעשיית התוכנה נשלטה בעבר על ידי חברות גדולות ובסיסי קוד קנייניים. כיום, מערכת ההפעלה הנפוצה ביותר על פני כדור הארץ - אנדרואיד - היא קוד פתוח. כל אחד יכול להעתיק ולהתאים אישית את הקוד בהתאם לצרכים ספציפיים או לשפר את בסיס הקוד לכל הקהילה. כשתבקר באינטרנט תראה תוכן ושירותים המועברים על ידי פרויקטים של קוד פתוח כמו לינוקס, ויקיפדיה, וורדפרס וכו '.
כמה שווי נקי של מייקל סטרהאן

פרויקט 9DS צפוי להיות יעיל נגד מלנומה, סרטן כליה וסרטן שד שלילי משולש. עם שינויים קטנים במולקולה, התרכובת יכולה להיות יעילה גם נגד סוגים רבים יותר של סרטן. הפרויקט קיבל עד כה התחייבות לכמעט 15,000 דולר מהיעד שלו בסך 50,000 דולר, בתוספת כמעט 2,800 דולר בביטקוין; 50,000 דולר יממנו את הפרויקט למשך כחצי שנה. במהלך אותה תקופה, יונמוטו מתכנן לייצר 9DS נוספים ולהגיש את התרכובת למחקר של קסנו-נפט כדי למדוד את יעילות התרופה כנגד קווים מסוימים של סרטן (אשר יקבלו צורה של 'ריפוי סרטן בעכברים', כפי שמסביר האתר) .

'זהו השלב הבא בפיתוח התרופות וחשוב בדרך לביצוע מחקרים קליניים (אנושיים)', מציין יונמוטו. 'אם נקבל יותר מימון, נוסיף יעדים נמתחים, כמו ניסויים פרה-קליניים נוספים ב- 9DS, אנלוגים לפיתוח 9DS או רעיונות מרגשים אחרים נגד סרטן.' הפרויקט בהובלת יונמוטו ואוואן פאוורס, ממציא שותף של התרופה טפמידיס, יספק סקירה עצמאית של מאמציו. קווית נודע שיונמוטו מתכוון לעשות זאת פרסם את הנתונים מתוך פרויקט מרילין בגלוי, אולי ב- GitHub, שם מפתחים מארחים באופן שגרתי פרויקטים של קוד פתוח.

קווית רוברט מקמילן גם מציין כי טקטיקות הגיוס של יונמוטו מנוגדות לשיטה הסטנדרטית לחקר תרופות, אך מייצגות חזרה לשיטות המחקר של תרופות באמצע המאה, כמו חיסון הפוליו, שפותח והופץ ללא מגבלות של פטנטים. יונמוטו אמר למקמילן כי 'הביולוגיה הופכת להיות יותר כמו תחום מדעי המחשב', כאשר המעבר מואץ על ידי התקדמות טכנולוגית כמו הרצף הממוחשב של הגנום האנושי.

בעוד שהטכנולוגיה לרצף גנום אנושי שלם קיימת רק כ- 15 שנה, הקשר החזק שאותה יצר בין מדעי המחשב לביולוגיה איפשר יותר ויותר לחוקרים לגשת לפרויקטים של מחקר רפואי באותו אופן שהמפתחים יתמודדו עם התהליך. של תכנון מערכת תוכנה גדולה. מייסד גוגל, סרגיי ברין, מתייחס במפורסם למוטציה בגנים שלו כאל באג בקוד האישי שלו, והרעיון למנף את יכולתה החישובית של גוגל לכוח המחקר הרפואי עומד מאחורי המחקר של גוגל, כמו מחקר הבסיס של גוגל X, וגיבויו של מיזמים אחרים כמו Calico, החוקרים הזדקנות, מחלות ניווניות וסרטן.

החוקרים מנסים לנצל את העלות הנמוכה של דברים כמו רצף של גנום אנושי שלם. עולה בערך 1,000 דולר , כפי שהסביר פרנסיס דה סוזה, נשיא אילומינה, יצרנית מכונות רצף דנ'א ב- MIT סקירת טכנולוגיות כנס EmTech. הוא העריך כי 228,000 גנומים אנושיים יופיעו ברצף השנה על ידי חוקרים ברחבי העולם, וכי לרוב נעשה שימוש ברצף להנחיית הטיפול בסוגים שונים של סרטן. אילומינה חושבת ששוק מחקרי ה- DNA המהירים עשוי להגיע ל -20 מיליארד דולר בשנה, כאשר מחציתם קשורים לחקר מחלות כמו מלנומה, סרטן ריאות או גידולים במוח.

GeneHub הוא סטארט-אפ בסן פרנסיסקו שהשיק ואז ביטל קמפיין קיקסטארטר למימון המונים השקת שירות שיציע רצף גנום שלם ליחידים. (הקמפיין בוטל בגלל סימנים מסחריים של חברת גנומיקה אחרת שתדרוש מ- GeneHub למתג מחדש.) הסטארטאפ עדיין מתכוון להציע את שירות רצף הגנום הראשון הזמין לכל אחד ומסביר את המניעים שלו:

'ב -11 השנים שחלפו מאז הסתיים פרויקט הגנום האנושי, המוסדות האקדמיים לא עברו מעט בהבנת המגוון המדהים שבא לידי ביטוי בגנום של אנשים. אנחנו בקושי מבינים איך הגנים שלך הופכים אותך, אתה. בעיה זו לא תיפתר במעבדה עם היעדר שיתוף נתונים ומנטליות סגורה של 'פרסם או מתים', אלא על ידי מתן גישה לך ולאנשים מבריקים אחרים שם לגנום שלך ולהעצים אותך לחקור, לשתף, לנתח, ולשלוט בגנום שלך. '

בעוד GeneHub מקווה לבנות עסק על ידי הצעת רצף הגנום כשירות, שאיפותיו תואמות גם את שאיפותיו של יונמוטו להנגיש נתונים רפואיים, ופתוחות למחקר על ידי אנשים מגוונים. באותו אופן שבו מפתחים הופכים את התוכנה שלהם למקוד פתוח בתקווה שאחרים יוכלו לדחוף את יכולותיה הלאה, ובכיוונים חדשים, הפיכת קוד פתוח למחקר רפואי וגנטי או לזמינה באופן נרחב עשויה בסופו של דבר להוביל לתגליות חשובות עבור חוקרים הנלחמים בסרטן ומחלות אחרות. .

אבל זה לא לפני שצומת ייחודי זה של ביולוגיה ומדעי המחשב מתגבר על כמה אתגרים. אחת מאלה היא בעיית תדמית: התפיסה שפרויקטים בתחום בריאות מימון המונים עוקפים את תהליך סקירת העמיתים המסורתי המעניק אמון לטענות מדעיות. פרויקט החסינות, גשש הפעילות של GoBe וצופית Scanadu העניקו כל אחד מהם תוקף לאותה מעוות. בעוד שסטארטאפים מבקשים לדמוקרטיזציה של מידע רפואי ומחקר, יהיה זה קריטי עבורם שיוכלו להוכיח את השערותיהם ולהדגים את הפוטנציאל של התרופות או הטכנולוגיה שלהם.

יתכן גם שפרויקטים של מחקר קוד פתוח יצטרכו למצוא דרך לגייס יותר כסף ממה שהם יכולים באמצעות מימון המונים, מכיוון שנדרש סכומי עתק לפיתוח וייצור תרופה. אם הם מבוצעים היטב, יוזמות כמו פרויקט מרילין לא רק מראות על תקפותה המדעית של תרופה או טיפול, אלא יכולות למשוך עוד חוקרים ומשקיעים לפרויקט. זה יכול להניע את תחומי המחקר החדשים המבטיחים, ואולי לקצר את התהליך הארוך הידוע לשמצה של פיתוח ובדיקה של תרופות וטיפולים חדשים - מה שאומר שכאשר יונמוטו או חוקר אחר יסיים את התרופה החשובה הבאה נגד סרטן, הם יוכלו להביא את החידוש הזה מהמעבדה לאמיתית. -חולים בחיים קצת יותר מהר.